L'objectif de cette déclaration des maladies transmissibles n'est pas d'identifier les personnes malades. En revanche, pour prendre des mesures prophylactiques, il peut être important de connaître l'identité du patient (par exemple dans une école, une maison de repos, etc.). Suite à une déclaration de maladie transmissible, le Service d'Inspection d'Hygiène peut prendre contact avec le médecin qui soigne le patient concerné. Ces contacts sont parfois nécessaires pour compléter les données médicales. Le Service d'Inspection d'Hygiène est soumis au secret médical. Les éléments d'identification du patient qui pourraient lui être transmis lors d'un tel contact restent confidentiels et sont rendus anonymes, après avoir pris les mesures sanitaires adéquates. Cette disposition est conforme à la loi relative à la protection de la vie privée et aux directives de l'Ordre des Médecins.
